Торговый эквайринг устанавливается на розничной точке. Для того, чтобы через него провести оплату, необходимо физическое присутствие человека. Интернет-эквайринг тоже принимает карты к оплате, но физически он не установлен на точке. То есть он находится где-то в Интернете, оплата картой производится через Интернет на любом расстоянии. Один интернет-эквайринг достаточно подключить на компанию, а что касается торгового эквайринга, то количество терминалов оплаты должно приравниваться количеству розничных точек.

У платежных агрегаторов  или банков нет абонентской платы за использование интернет-эквайринга, но всегда есть комиссия. Платежные системы существуют за счет комиссии от оборотов, обычно комиссия варьируется от 1,8% до 9%. Высокий размер комиссии может встречаться у компаний, работающих по агентским схемам. Компания Бизнес.Ру Онлайн-чеки предлагает фиксированную сумму за свой сервис.

Онлайн-касса и интернет-эквайринг взаимодействуют друг с другом напрямую. То есть интернет-эквайринг — это возможность списывать деньги с карты, а ККТ дает возможность пробить чек и работать законно. Есть организации, которым не нужна касса по закону, например, ИП на патенте, самозанятые. В таких случаях, интернет-магазину может быть достаточно интернет-эквайринга, и при этом не обязательно устанавливать себе кассу.

Через ЛК платежной системы, нажать кнопку «возврат» и деньги вернутся на карту. Возвратный чек автоматически отправится от платежной системы. Это стандартный функционал ЛК платежных систем.

Интернет-эквайринг — это всего лишь возможность списывать деньги с карты. Одновременно с этим существуют виды деятельности, которым запрещено торговать в интернете, соответственно, принимать онлайн-платежи. Это прописывается в «Правилах дистанционной торговли».

Запрещена торговля алкогольными напитками, табачной продукцией, оружием без лицензии и средствами защиты, а также техникой, предназначенной для негласного получения информации и оборудованием, используемым для проведения азартных игр.